肥胖对性功能是有一定影响的。对于肥胖男性而言，重度肥胖者体内的游离睾丸酮（也就是具有生理活性的那一部分睾丸酮）水平较正常人低，而且在作兴奋试验时的升高程度也远远不如普通人。另一方面，雌激素是在脂肪组织内产生的，脂肪组织越多，雌激素合成的越多，所以肥胖男性体内的雌激素水平比普通男性要高，少数人甚至可以因此而产生阳痿以及乳房发育等女性化表现。
所以总的来说，肥胖男性的性欲以及性功能有可能下降。肥胖女性的情况与男性有所不同，由于高胰岛素血症可以刺激卵巢产生过多的雄激素，所以体内的游离睾丸酮水平可能比普通女性高，导致女性出现多毛等男性化表现，还可引起月经紊乱甚至闭经、不育。另外，肥胖女性往往容易合并黑棘皮病，表现为脖子、腋下和大腿根部皮肤又黑又粗。肥胖女性的皮肤还容易长癣、长疖子，再加上男性化表现，非常影响妇女的容貌，对性生活造成不良的心理影响。肥胖还对性交体位的选择有所限制，不利于性生活的质量。肥胖者容易患糖尿病，有糖尿病的男性可继发阳痿，女性可因此而出现性冷淡和阴道炎，可能进一步影响性功能。